自2012年12月1日全省交通运输业实行营业税改征增值税试点后，台州市各级港航管理部门密切关注航运企业税负变化情况，走访全市20多家重点企业，及时了解企业经营动态、税负情况和存在的问题，确保“营改增”试点工作顺利开展。

    2013年全市参与“营改增”调查的65家航运企业中一般纳税人46家（其中有11家企业由小规模纳税人转为一般纳税人），小规模纳税人19家。65家企业实施“营改增”后2013年共入库增值税税款3848万元。其中36家一般纳税人企业税负比试点前有不同程度降低，共减少增值税税负1812万元，单家企业减少税负最多为265万元；21家企业税负与试点前持平；8家一般纳税人企业税负比试点前有不同程度上升，共增加税负810万元，单家企业税负增幅最大为43%。

     从试点的情况来看，台州航运企业税负总体下降。一方面是因为当前运价低迷，航运企业毛利较低，因而企业的销项税额较低，增值税税负也较低；另一方面是企业的燃油费、维修保养费、港口使费以及有些企业新建和购买的新船可以进行进项税额抵扣，在一定程度上减少了企业税负。但如果航运市场回暖，运价回到正常水平，企业的增值税税负必然会相应增加，在到达一定点后，“营改增”后的企业税收负担就会超过原征收营业税的税负。